中国科学院深圳先进技术研究院（以下简称"先进院"）于2006年2月由中国科学院、深圳市人民政府及香港中文大学三方合作共建。历经12年发展，先进院构建了以科研为主，集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，打造了科技创新有效服务经济社会发展的"先进院模式"，成为全国新型科研机构的典型代表之一。科研方面：拥有近80个国家/省市级创新载体，牵头深圳市合成生物、脑科学重大科技基础设施及3个基础研究院建设；2018年合同经费超十亿元，获批竞争性科研经费稳居深圳第一。教育方面：拥有一支国际视野的导师队伍（共264人）；拥有1个博士后流动站、4个一级学科博士培养点和6个硕士培养点；牵头中国科学院大学生物医学工程学科建设在教育部第四轮学科评估中获B+（前15%，深圳高校第一）；累计培养研究生近7000人，培养质量获学术界和产业界认可，优秀毕业生留深工作起薪达27万/年，自主创业的毕业生中也不乏已获2.1亿投资的案例；累计培养博士后549人（占深圳10%）。产业和资本方面：累计孵化企业727家，持股199家，估值过百亿的1家，估值过亿的达28家，有效实现了科技、教育与经济社会发展的融合。先进院孵化众多企业的典型代表"联影"，已成为"独角兽"企业。
2018年11月16日，深圳市人民政府与中国科学院签署《合作共建中国科学院深圳理工大学协议书》，双方将依托先进院和在深圳布局的重大基础设施，以及中国科学院在粤科研力量，建设世界一流、小而精的研究型大学。学校将在人工智能、信息技术、生命健康、生物医药、新能源、新材料、创新创业等领域设置相关学科专业，形成以理、工、管为主要门类的学科体系，建立本硕博一体化人才培养体系，最终实现全日制在校生规模8000人。
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