2015年1月,为加快广东自贸区建设,提升暨南大学协同创新能力,南沙开发区管委会与暨南大学本着“优势互补、合作共赢”的原则,决定联合共建暨南大学中国(广东)自由贸易区研究院。研究院实行理事会领导下的院长负责制,牢固树立“扎根南沙,服务广州”的核心理念,以金融创新与产业发展研究、国际贸易与粤港澳合作研究、法治化国际化营商环境研究为三大主攻方向,在组织架构建设方面初步形成了“126”的基本格局(即一个委员会、两个中心和六大研究团队)。在南沙区管委会的正确领导和大力支持下,研究院积极携手南沙新区相关部门,加强合作办学,为南沙在建设国家级新区、自由贸易试验区、广州市城市副中心、粤港澳深度合作示范区、对外开放门户枢纽等发展战略中做出了积极的贡献,并在决策咨询、科学研究、社会服务、人才培养等方面取得了较好的成效。